بتشريف رئيس مجلس إدارة جامعة النيلين الفريق مهندس الفاتح عروة ورعاية مدير الجامعة بروفيسور أحمد الطيب مُحَمَّد وحضور نائب مدير الجامعة بروفيسور محمد سعيد الطاهر ووكيل الجامعة بروفيسور أسامة مُحَمَّد عثمان وعمداء الكليات ومدراء الإدارات والأساتذة والموظفين، عقدت الجامعة في يوم 13 فبراير 2012م المؤتمر الأول للإدارات تحت شعار "نحو أداء مؤسسي متميز"..
وفي كلمته أمام المؤتمر أشار الفريق مهندس الفاتح عروة رئيس مجلس إدارة الجامعة إلى أهمية وضع رؤية استراتيجية للجامعة تضمن كفاءة الأداء الإدراي عبر تفويض الصلاحيات مع الإهتمام بالإجراءات عبر النظم المؤسسية ودعا الفريق عروة إلى الاستغلال الأمثل للموارد المتاحة.. فيما أكد بروفيسور أحمد الطيب مُحَمَّد مدير الجامعة على التزام الجامعة بمبدإ التخطيط المستقبلي برؤى للتحديث تتم الآن بلورتها عبر عدد من المؤتمرات شارك فيها جميع منسوبي الجامعة بما فيهم الطلاب من أجل الوصول إلى مشروع واضح المعالم يؤدي إلى نهضة الجامعة وتقدمها. ومن جانبه وصف بروفيسور أسامة مُحَمَّد عثمان وكيل الجامعة مؤتمر الإدارات بالخطوة الهادفة إلى إصلاح الحاضر والنظر إلى المستقبل مؤكداً إهتمامه بتوصيات المؤتمر. وقال دكتور عارف الحاج العيدروس رئيس اللجنة المنظمة للمؤتمر – مدير إدارة الجودة بالجامعة قال إن المؤتمر حلقة هامة مكملة لسلسلة المؤتمرات الأخيرة التي انتظمت مؤسسات الجامعة سعياً وراء الوصول للتطوير وتحقيق أهداف الجودة .
وكرمت جامعة النيلين في المؤتمر خمسة من وكلاءها السابقين الذين تعقابوا على المنصب منذ قرار الرئيس عمر البشير بسودنة جامعة القاهرة فرع الخرطوم لتصبح جامعة النيلين في شهر مارس 1993م، وهم على التوالي الأستاذ أحمد إسماعيل النضيف وبروفيسور مُحَمَّد زائد بركة وبروفيسور عبدالعزيز عبد الرحيم ودكتور عبد المطلب أبنعوف وبروفيسور مُحَمَّد بخيت جيلاني.
قُدِّمت أوراق المؤتمر في جلستين، ترأس الجلسة الأولى دكتور فكري كباشي نائب عميد كلية الدراسات العليا حيث قدم الأستاذ عبد الله آدم البشاري مدير إدارة الموارد البشرية بالجامعة ورقة بعنوان "الخطة الإستراتيجية لإدارة تنمية الموارد البشرية"، وقدم الأستاذ مُحَمَّد بدر حامد مدير الإدارة المالية ورقة بعنوان "الإدارة المالية الماضي ورؤى المستقبل"، وقدم مدير إدارة الاستثمار الأستاذ ياسر عثمان ورقة بعنوان "إدارة الاستثمار .. أفكار جديدة"، وقدم مدير إدارة الخدمات الأستاذ عاطف رجب نصر ورقة بعنوان "إدارة الخدمات الواقع والرؤى المستقبلية"، وقدم مدير الإدارة الهندسية مهندس إسماعيل عثمان بخيت ورقة بعنوان "الإدارة الهندسية .. المشاكل والحلول".. وعقّب على أوراق الجلسة دكتور عبد المطلب أبنعوف.
وفي الجلسة الثانية قدم مدير إدارة العلاقات العامة والإعلام الأستاذ عبد القادر الخزين ورقة بعنوان "إدارة العلاقات العامة.. الماضي الحاضر والمستقبل"، وقدم دكتور الخاتم أبو اليسر ورقة إدارة تقنية المعلومات والاتصالات وكانت بعنوان "تطور تقانة المعلومات والاتصالات بالجامعة"، وقدم قائد الحرس بالجامعة عقيد شرطة كمال الدين محمد عثمان ورقة بعنوان "دور الحرس الجامعي في تأمين واستقرار الجامعة.. المشاكل والحلول"، وقدم دكتور عارف الحاج العيدروس مدير إدارة الجودة ورقة بعنوان "معايير الجودة وعناصر التقييم الذاتي بجامعة النيلين".. وعقّب على أوراق الجلسة بروفيسور مُحَمَّد بخيت جيلاني، وتم فتح المجال للحاضرين الذين أثروا الجلسة بالتأكيد على التوصيات التي ركزت على توفير المعينات اللازمة لإدارات الجامعة والاهتمام ببيئة العمل وتوسيع فرص التدريب لبناء القدرات وتفعيل مشروع الإسكان ودار العاملين وتنشيط إدارة الاستثمار وإدارة العلاقات العامة والإعلام.