في احتفال رئاسي شهده كل من فخامة المشير عمر حسن أحمد البشير رئيس الجمهورية ورئيس جمهورية تشاد ادريس دبي ورئيس جمهورية افريقيا الوسطى بمدينة الفاشر بمناسبة إنفاذ وثيقة سلام دارفور، كان لجامعة النيلين السبق الكبير بمنح درجة الدكتوراه الفخرية لسمو الأمير تميم بن حمد آل ثاني أمير دولة قطر، والتي أجازها مجلس أساتذة الجامعة في جلسته رقم (95) بتاريخ 17 يوليو 2016 م استنادا على قانون جامعة النيلين لعام 1995م برئاسة البروفيسور/ محمد الأمين أحمد، وذلك تقديرا لمجهودات سمو أمير دولة قطر في تحقيق السلام بدارفور، و لدوره البارز في إرساء مبادئ حكم القانون ومكافحة الفساد في المنطقة. حيث تلا البروفيسور محمد الأمين مدير الجامعة قرار مجلس الأساتذة وسلّم سمو الأمير شهادة الدكتوراه. وتلقى سموهّ التهنئة من فخامة رئيس الجمهورية والسّادة الرؤساء.
الجدير بالذكر أنّ جامعة النيلين ترتبط ارتباطا وثيقا بدولة قطر؛ حيث تمّ اختيارها من قِبل المحامي العام للأمم المتحدة بالمنطقة و ئيس مجلس حكم القانون ومكافحة الفساد النائب العام القطري د. علي المري مقرا لكرسي حكم القانون ومكافحة الفساد لما تتميز به الجامعة من كلية رائدة في مجال القانون في الوسطين العربي والإفريقي، حيث يلعب الكرسي دورا وطنيا كبيرا كمراقب مستقل لاستفتاء دارفور الإداري الذي أعدّ حوله تقريرا مفصلا تم عرضه على الأمين العام للأمم المتحدة بان كي مون.
وفي ذات السياق، أكد البروفيسور محمد الأمين مدير الجامعة أن اختيار الجامعة لسمو الأمير يأتي تقديرا للدور الكبير الذي لعبته دولة قطر بقيادة سمو الأمير في تحقيق السلام بدارفور، و لرعايته المباشرة لمجلس حكم القانون ومكافحة الفساد بدولة قطر.
وقد حُظِي تسليم الدكتوراه باهتمام إعلامي كبير في وسائل الإعلام السودانية والقطرية والعالمية.