بالإضافة الي اهداف الكلية كوعاء اكبر يهدف هذا البرنامج الى:

1. خدمة النواحي البحثية في مجال الحاسوب.
2.  تخريج متخصصين في مجال الحاسوب.
3. سد نقص خريجي علوم الحاسوب في السودان . 
4. محو أمية الحاسوب .